25 Przykład enzymu ligazy: szczegółowe fakty

Słowo „ligaza” oznacza łączyć się lub wiązać. Katalizuje łączenie dwóch makrocząsteczek poprzez tworzenie nowych wiązań, takich jak wiązania między CO, CN, CS itp.

• Ligazy aminoacylo-tRNA
• Ligazy kwasowo-etanolowe
• Syntetaza beta-laktonowa olefiny
• Ligazy kwasowo-tiolowe
• Ligazy kwasowo-amonowe
• Syntazy peptydów
• Ligazy cykliczne
• Syntaza NAD +
• Syntaza fosforybozyloformyloglicynamidyny
• Syntaza asparaginy
• Syntaza karbamoilofosforanu
• Syntaza asparaginyl-tRNA
• Syntaza glutaminylo-tRNA
• Karboksylaza pirogronianowa
• Karboksylaza acetylo-CoA
• Karboksylaza propionylo-CoA
• Karboksylaza metylokrotonoilo-CoA
• Karboksylaza Geranoilo-CoA
• karboksylaza acetonowa
• Karboksylaza 2-oksoglutaranu
• Syntetaza koenzymu F430
• Ligazy DNA
• Ligazy RNA
• Chelataza Magnezu
• Kobaltochelatazy
• Ligazy ubikwityny

Ligaza należy do jednej z sześciu klas enzymów (klasyfikacja enzymatyczna/EC:6).

W biologii enzym ligaza jest również określany jako „klej molekularny” ze względu na jego właściwość łączenia fragmentów DNA poprzez katalizowanie tworzenia wiązania fosfodiestrowego.

Zobaczmy niektóre z Ligase przykłady enzymów.

1. Ligazy aminoacylo-tRNA

Wiązanie węgiel-tlen powstaje między aminoacylo-tRNA. Enzym ten jest niezbędny do tłumaczenia białka na rybosomach przy użyciu tRNA. Tutaj „aminoacyl” odnosi się do pojedynczego aminokwasu. Istnieje około 25 ligazy aminoacylo-tRNA.

2. Ligazy kwasowo-etanolowe

Wiązanie węgiel-tlen powstaje między grupami kwasowymi i OH. Enzym ligazowy należący do tej kategorii jest również nazywany syntazami estrowymi. Słowo syntazy oznacza, że ​​reakcja może być katalizowana bez użycia ATP/wydatku energetycznego

3. Syntetazy beta-laktonowe olefin

Enzym ten znajduje się w szlaku biosyntezy węglowodorów olefinowych.

4. Ligazy kwasowo-tiolowe

Ligazy kwasowo-tiolowe, jak sama nazwa wskazuje, tworzy wiązanie między węglem grupy kwasowej a siarką grupy tiolowej. Enzymy te biorą udział głównie w: kwas tłuszczowy synteza i metabolity wtórne w organizmach żywych.

5. Ligazy kwasowo-amonowe

Są one powszechnie znane jako syntazy amidowe. Katalizuje reakcję ligacji między kwasem a amoniakiem, tworząc wiązanie między węglem a azotem.

6. Syntazy peptydów

Ligazy peptydowe są również nazywane, ponieważ katalizują tworzenie wiązań między peptydami i białkami oraz pewnym specyficznym substratem. Powstaje wiązanie między węglem a azotem

7. Ligazy cyklo

Katalizują tworzenie wiązań węgiel-azot w cząsteczce, powodując w ten sposób powstanie pierścienia heterocyklicznego.

8. Syntazy NAD+

Jest to skrót od syntazy dinukleotydów nikotynowo-adeninowych. Wiązanie węgiel-azot powstaje między trzema ważnymi substratami: ATP, NAD i amoniakiem.

9. Syntazy fosforybozyloformyloglicynamidu

Katalizuje reakcję poprzez tworzenie wiązania węgiel-azot, w którym cząsteczką donorową jest glutamina.

10. Syntazy asparginy

Jest jednym z enzymów porządkowych ssaków. Jest fizjologicznie niezbędna i bierze udział w cyklu mocznikowym, gdzie katalizuje konwersję asparaginianu do asparaginy.

11. Syntazy fosforanu karbamoilu

Katalizuje powstawanie fosforanu karbomylu, który jest kluczowym etapem biosyntezy pirymidyny i argininy.

12. Syntaza asparginyl-tRNA

Tworzy wiązanie węgiel-tlen, aby wytworzyć L-asparginę. Bierze również udział w metabolizmie asparaginianu i alaniny.

13. Syntaza glutaminylo-tRNA

Należy do dwudziestu syntaz t-RNA zaangażowanych w tworzenie glutaminy.

14. Karboksylazy pirogronianowe

Jest niezbędnym enzymem cyklu Kreba, gdzie katalizuje powstawanie szczawiooctanu.

15. Karboksylazy acetylo-CoA

Katalizuje nieodwracalną reakcję karboksylotransferazy z wytworzeniem malonylo-CoA.

16. Karboksylazy propionylo-CoA

To skrót od PCC. Dysfunkcja tego enzym prowadzi do metabolizmu kwasica.

17. Karboksylazy metylokrotonoilo-CoA

Katalizuje zależną od ATP karboksylację 3-metylokrotonoilo-CoA. Niedobór tego enzymu powoduje metylokrotonyloglicynurię.

18. Karboksylazy geranoilowe

Jest to biotyna zawierająca enzym karboksylazy. Głównie w roślinach i bakteriach.

19. Karboksylazy acetonowe

Jest to rodzaj zależnej od ATP karboksylazy, która katalizuje tworzenie wiązań między jej substratem acetonowym a jonem wodorowęglanowym

20. Karboksylaza 2-oksoglutaranowa

Jak sama nazwa wskazuje, pomaga w tworzeniu wiązań między 2-oksoglutaranem a jonem wodorowęglanowym w obecności ATP.

21. Syntetazy koenzymu F430

Enzym ten ma charakterystyczną cechę zawierania centrum pochodzącego z tetrapirolu.

22. Ligazy DNA

Wykorzystuje ATP lub NAD+ do utworzenia wiązania fosfodiestrowego między dwiema zasadami w DNA.

23. Ligazy RNA

Tworzy wiązanie między grupą hydroksylową 3' i grupą fosforanową 5' cząsteczek RNA. A do tej reakcji potrzebuje ATP, który jest konwertowany na AMP.

24. Chelataza magnezowa

Jego podstawową rolą jest synteza chlorofilu i bakteriochlorofilu. Pomaga w umieszczeniu jonów magnezu w dziewiątym rdzeniu kompleksu porfiryny.

25. Kobaltochelatazy

Tworzy wiązania azot-D-metal. Odgrywa centralną rolę w szlaku biosyntezy witaminy B-12.

26. Ligazy ubikwityny

Ta ligaza umożliwia przeniesienie ubikwityny z cząsteczki nośnika na substrat białkowy. Istnieją różne rodzaje ligaz ubikwityny, które są specyficzne dla substratu.

Podsumowanie

Nasz post podsumował różne przykłady enzymów ligazy w oparciu o ich specyficzność dla substratów i tworzenie wiązań katalizowane przez enzym ligazę. Można stwierdzić, że enzym ligaza występuje w organizmach żywych i ma zastosowanie w biotechnologii i badaniach przemysłowych.

Przeczytaj także:

• Przykłady komensalizmu
• Funkcje mitochondriów komórek roślinnych
• Czy białka nośnikowe są aktywne?
• Etapy mejozy 2
• Przykłady nukleotydów
• Czy bakterie mają chloroplasty
• Struktura chromosomów grzybów
• Przykłady enzymów transferazy
• Ruch wody przez ścianę komórkową
• Czy siateczka śródplazmatyczna ma błonę?