Czy adenina jest pirymidyną: szczegółowe fakty?

Adenina nie jest pirymidyną, ale raczej puryny nukleozasada, czyli zasadowa cząsteczka azotu.

Jedna z najważniejszych nukleozasad tworzących struktury nukleotydowe nukleotydów zarówno w DNA, jak i RNA. Adenina wiąże się w komplementarnym połączeniu z tyminą w DNA lub uracylem w RNA i tworzy podwójne wiązanie.

Tak więc, aby odpowiedzieć na pytanie „Czy adenina jest pirymidyną”, musimy zrozumieć kontekst zasad nukleinowych puryn i pirymidyna.

Tautomerem najczęściej używanym w wyjaśnieniach biologicznych jest tautomer 9H. Struktura składa się z 2 cyklicznych łańcuchów C – jeden jest pentamerem, a drugi heksamerem, ale w obu niektóre atomy węgla są zastąpione azotem.

Wszystko o Adeninie:

  • Mając wzór chemiczny C5H5N5i ma łącznie 9 członowych skondensowanych pierścieni.
  •  Adenina to baza organiczna.
  • Nazywa się to bazą purynową, czyli a heterocykliczna cząsteczka składająca się z węgla, wodoru i azotu głównie.
  • Adenina może zasadniczo występować w czternastu formach tautomerycznych.
  • Ze względu na swoją cykliczną strukturę Adenina ma charakter chemicznie hydrofobowy, tzn. odpycha wodę.
  • Adenina jest cząsteczką składową zarówno w DNA, jak i RNA nukleotydy.
  • Związki adeniny obejmują Kobalamina lub witamina B12, a także trójfosforan adenozyny (ATP) która jest uważana za główną walutę energetyczną w większości organizmów.
  • Uzupełniające adeninę wiążą się z tyminą w DNA i Uracyl w RNA odpowiednio przez parę linków w obu przypadkach.
1280px Para podstawowa AT.svg
Jak adenina wiąże się z tyminą?
Obraz: Wikipedia
is-adenina-a-pirymidyna
Struktura adeniny z pokazaną numeracją
Obraz: Wikipedia

Biosynteza adeniny:

  1. Adenina powstaje podczas puryny metabolizm lub awarii.
  2.  Nukleotydowy monofosforan inozyny (IMP) jest początkowym związkiem generującym zarówno adeninę, jak i guaninę.
  3. Glicyna, glutamina i kwas asparaginowy należą do aminokwasów tworzących IMP.
  4. Tetrahydrofolian koenzymu, który sam powstał z istniejącego wcześniej fosforanu rybozy, jest również używany do wytwarzania IMP.

Czy adenina jest puryną?

Adenina jest w najbardziej określonym sensie puryną.

Struktura adeniny składa się z sześcioczłonowego pierścienia i połączonego ze sobą pięcioczłonowego pierścienia, który jest główną podstawową strukturą puryn. Adenina jest podstawioną cząsteczką puryn.

1024px Purin num2.svg
Uogólniona struktura purynowa przedstawiająca pierścień pirymidynowy i imidazolowy z numeracją Zdjęcie: Wikipedia

Puryny to heterocykliczne cząsteczki aromatyczne zawierające pierścień imidazolowy skondensowany z pierścieniem pirymidynowym w swojej strukturze chemicznej, obecne w kwasach nukleinowych – DNA i RNA, a także w alkaloidach, takich jak kofeina w kawie i teofilina w herbacie.

Adenina ma w swojej strukturze łącznie dziewięć atomów. Dwa cykle są sześcio- i pięcioczłonowe, tj. odpowiednio pierścień pirymidynowy i imidazolowy. Purynę numeruje się w kierunku przeciwnym do ruchu wskazówek zegara, zaczynając od pierwszego azotu w sześcioczłonowym pierścieniu. Pierścień imidazolowy ma system numeracji zgodny z ruchem wskazówek zegara.

Puryny znajdują się w ATP, GTP, cykliczny AMP, NADH i koenzym A, wśród innych znaczących związków. Chociaż formy aminowe i okso przeważają w warunkach fizjologicznych, puryny mają grupę NH2 i grupy okso, które wykazują tautomerię keto-enolową i aminowo-iminową.

Purines.svg
Struktury najpopularniejszych puryn
Obraz: Wikipedia

Licząc w ten sposób widzimy, że N jest ogólnie obecne na pozycjach 1, 3, 7 i 9. Adenina ma również te 4 atomy N wraz z dodatkowym NHgrupa przyłączona do atomu węgla w pozycji 6 w pierścieniu pirymidynowym.

Czy adenina jest podstawioną pirymidyną?

Pod względem biologicznym adenina nie jest podstawioną pirymidyną, ale raczej podstawioną puryną.

Struktura pirymidyny jest o wiele prostsza i składa się z pojedynczego sześcioczłonowego pierścienia, zawierającego azot w pozycjach 1 i 3. Z drugiej strony adenina, która jest puryną, składa się z pierścienia pirymidynowego połączonego z pierścieniem imidazolowym.

1024px Pirymidyna 2D aromatyczna pełna.svg
Uogólniona struktura pirymidyny
Obraz: Wikipedia

Pirymidyna ma wzór chemiczny C4H4N2 i jest heterocykliczną aromatyczną cząsteczką organiczną. Ma pojedynczy pierścień (pierścień pirymidynowy) zawierający naprzemienne atomy węgla i azotu. Pirymidyna zawiera cytozynę (C) i tyminę (T) w DNA i uracyl (U) zamiast tyminy w RNA. Nawet tiamina lub witamina B1 jest w rzeczywistości pochodną pirymidyny.

1280px Para podstawowa AU.svg
Jak Adenina wiąże się z Uracil
Obraz: Wikipedia

Więc przykłady podstawionego pirymidyna obejmuje- Cytozyna, między innymi tymina, uracyl, tiamina i alloksan.

Przeczytaj także: